Não estou ganhando nada indicando o banco Inter, mas como tem me ajudado bastante, espero que ajude você também.

O banco Inter está oferecendo 100 boletos por mês gratuitos, ou seja, se você paga por exemplo R$ 2,00 por mês por cada boleto, com o banco Inter você economiza R$ 200,00 por mês. Como o banco Inter não tem ainda uma integração com o WHMCS, você pode usar esta opção para enviar cobranças avulsas, como alguns serviços adicionais que os clientes solicitam. Lembrando que é necessário ter conta pessoa jurídica. Tenho usado e é muito bom. Segue mais informações: https://bancointer.com.br/conta-corrente-pj.jsf

Se tivesse uma API, seria top que dava pra emitir os boletos através do WHMCS.

100 boletos por mês são 4 boletos por dia útil... nesse volume não precisa de API. ;-)

Agora, rubensk disse:

100 boletos por mês são 4 boletos por dia útil... nesse volume não precisa de API. ;-)

Porém se limitar ao módulo emitir os 4 por dia útil, ainda sim é vantagem.

3 minutes ago, Joel Emanoel said:

Porém se limitar ao módulo emitir os 4 por dia útil, ainda sim é vantagem.

E ao dizer que seu boleto ora é de um banco ora é de outro, meio caminho andado para boleto falsificado não ser percebido pelo seu cliente. 

1 minuto atrás, rubensk disse:

E ao dizer que seu boleto ora é de um banco ora é de outro, meio caminho andado para boleto falsificado não ser percebido pelo seu cliente. 

O Paghiper atualmente faz isso, as vezes é Itaú, as vezes é Bradesco...

1 minute ago, Joel Emanoel said:

O Paghiper atualmente faz isso, as vezes é Itaú, as vezes é Bradesco...

Se eles estiverem em transição, é uma mitigação de risco operacional que eu também faria... mas como longo-termo, não é o melhor.