Vou tentar explicar o que preciso fazer:

Tenho um cliente que possui um domínio (dominio1.com.br) e um dominio adicional (dominio2.com.br) apontando para esse domínio.

Agora ele "vendeu" esse dominio adicional, então preciso criar uma nova conta no cpanel, para dominio2.com.br

O problema é que existem contas de email em dominio2.com.br e preciso transferir essess emails também... Alguém tem alguma sugestão ? Uso uma conta de revenda e não tenho acesso root ao servidor.

Não sei se da certo, quando tu for no gerenciador de arquivos do cpanel.

Lá poderá verificar a pasta mail.

Lá tem todas as contas de email da hospedagem (logo, tem do domínio 1 e 2)

Então, tu seleciona as pastas do domínio 2, compacta.

E depois de criar uma nova hospedagem, descompacta a pasta na mesma estrutura.

Acredito que possa dar certo.

O problema deste procedimento é que você precisa remover o domínio 2 do adicional, então faça backup antes para não correr muito risco.