Olá.

Estou tendo um problema com um VPS, que é o seguinte:

O Sistema WHM gera os backups mas quando chega no servidor ftp de destino eles chegam vazios. Quando eu desligo o CSF os backups vão normalmente. Ja tentei reinstalar o CSF mas o problema continua.

Oque posso fazer?

Libere as portas passivas do FTP no CSF, de acordo com as setadas na config do Servidor FTP.

As portas passivas ja estão liberadas.

Como podem ver no print pelo link as portas estão OK.

http://awesomescreenshot.com/0a9itdn75

Eu tambem estava com esse problema, veja se o servidor de destino (bkp) estão com as mesmas portas de quem esta enviando.

Testei em três servidores de backups diferentes e da o mesmo problema, em uma delas o firewall estava desligado para teste.

Qual o erro que aparece no log do backup?

Simples. Libere o IP do outro servidor no seu e o do seu no outro através de Plugins -> ConfigServer Security&Firewall -> Quick Allow.