Para configurar a execução de determinada versão do PHP, siga os passos abaixo:

Crie um arquivo .htaccess dentro da raiz da pasta do site -- ex.: se for o site principal esta pasta será public_html -- e coloque o seguinte:

Options +ExecCGI
AddHandler php-cgi .php
Action php-cgi /cgi-bin/php.cgi

Agora crie uma pasta de nome cgi-bin dentro da raiz da pasta do site e crie um arquivo de nome php.cgi dentro dela.
Certifique-se de aplicar neste arquivo a permissão 755 via FTP ou através do gerenciador de arquivos do cPanel.
 

Edite o arquivo php.cgi e coloque o seguinte (substitua <VERSAO_DESEJADA> por uma das versões listas abaixo):

#!/bin/sh
/opt/php/<VERSAO_DESEJADA>/bin/php-cgi -c /home/`whoami`/php.ini

Por favor, note que somente as versões 5.2, 5.3, 5.4 e 5.5 estão disponíveis atualmente.
Para configurar diretivas do PHP, você pode criar um arquivo php.ini dentro da raiz da conta cPanel.

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2 horas atrás, Davi Claudino disse:

Por favor, note que somente as versões 5.2, 5.3, 5.4 e 5.5 estão disponíveis atualmente.

Isso é relativo, depende da versão do PHP instalado no servidor. Para quem tem Cloudlinux recomendo fazer direto no PHP selector e quem não tem faca no Multi-php