Não estou ganhando nada indicando o banco Inter, mas como tem me ajudado bastante, espero que ajude você também.
O banco Inter está oferecendo 100 boletos por mês gratuitos, ou seja, se você paga por exemplo R$ 2,00 por mês por cada boleto, com o banco Inter você economiza R$ 200,00 por mês. Como o banco Inter não tem ainda uma integração com o WHMCS, você pode usar esta opção para enviar cobranças avulsas, como alguns serviços adicionais que os clientes solicitam. Lembrando que é necessário ter conta pessoa jurídica. Tenho usado e é muito bom. Segue mais informações: https://bancointer.com.br/conta-corrente-pj.jsf