Cara, os caras tem razão mais tem opções que devem ser ativadas por quase obrigação.
Como por ex:
ModRuid2 - Você concerteza tem que ativar ele, ele faz com que a execução de aplicações seja isolada de cada usuário, utilizando suas próprias permissões(assunto complexo de falar kkk, mas ele é muito útil para segurança) além de deixar o carregamento mais rápido.
MimeMagic- Muitos scripts de loja virtuais, utiliza este modulo, se vc quer rodar uma loja virtual, concerteza este modulo é bom.
SysTimezone- Deve ativa, se não vai ter muitos problemas com scripts que captura a data e hora do servidor, se não tiver configurado o timezone, os scripts vai começa a gerar muitos erros.
SourceGuardian- Ativa ele, quem sabe, pode ter um script que utiliza a encriptação deste modulo.
ModSec- Ativa ele para proteger de ataques, ele vai agir junto com o seu ModSecurity app que esta no seu WHM
Nota: O ModRuid2 para ativa-lo é preciso ativar também o MPM Prefork, e também se não me engano, ele não é compativel com mpm itk na hora de iniciar o build desmaque este module.
E depois de termina o build, lembre-se de alterar o timezone no PHP, trocando de UTC para America/Sao_Paulo, em Configuração de Serviço > Editor de configuração PHP > Modo avancado> ai é só procurar por date.timezone.
Espero ter ajudado :D