Desinstalei o mysql, não fiz backup do banco, mas fiz backup dos arquivos: ibdata1, ib_logfile0 e ib_logfile1.

O arquivo ibdata1 tem 17GB, no my.cnf o innodb_file_per_table=0.

Como faço para recuperar esses dados ? Existe algum software ou procedimento que faça com que eu tenha esses dados de volta?

Obs:Tenho o xampp instalado e pretendo testar com ele.

Você pode tentar reconstruir o banco de dados manualmente e upar os arquivos na db, software de recuperação automática não sei se existe não.