sei que é no WHM, só que não estou entendo a ligação, o acesso vindo do WHMCS que faz um redir usando hostname (configuração de servidor no WHMCS) + porta + ID, esse ajuste é no WHMCS não no WHM.
Fiz um teste só para tirar a febre:
Home >> Server Configuration >> Tweak Settings
Require SSL: off (obriga o redir para https nos acessos whm, cpanel, webmail)
Non-SSL redirect destination: (Permite especificar o redir para os usuários que acessam cPanel & WHM sem SSL.)
Origin Domain Name (redireciona um usuário para seu domínio principal (por exemplo, exemplo.com:2082, onde exemplo.com é o domínio do usuário)
Para isso Funcionar o WHMCS teria que passar o domínio da conta como origem e desta forma não teria sentido essa configuração.