Obrigado pela resposta.
Eu fiz isso e mesmo assim dá como recusado pelo RegistroBR.
Pingando ns2.dominio.com ele retorna o IP com a latência normalmente,
Falei com o registroBR e a reposta foi:
" Quando você tenta alterar o DNS do domínio apontando para a sua revenda com WHM, o RegistroBR manda uma requisição para o servidor e aguarda as informações como retorno. O seu NS2 não está retornando e é isso que está causando o problema".
Bom, enviei por ticket para o Cpanel, se resolver eu marco como resolvido.
Obrigado novamente!