Obrigado Tecsecret.
Mas seria justamente a parte de cobrança e quitação automática que estou procurando. Existem módulos PagSeguro para o Woocommerce, mas será que permite controle de mensalidades? Como esse é gratuito, posso fazer um teste.
Conheço o Moodle e não me agrada. Ele poderia ser útil para cursos online, mas para cursos presenciais não é tão necessário.
Mas a minha preocupação mesmo seria a parte de cobranças, com quitação automática pelo Moip, Pagseguro etc.
Esse parece ser muito bom. Pena que os convênios de cobrança são separados. Mas pode ser uma opção sim, obrigado pela dica.