Ol@,
Parece que você está usando a base de dados para guardar a sessão do usuário no Moodle, isso pode causar muita carga no MySQL, especialmente se você está usando MyISAM e não Innodb (recomendo).
Se você estiver usando a última versão estável, considera usar um plugin de caching, como o memcached (que pode ser distribuído entre vários servidores).
http://docs.moodle.org/26/en/Session_handling
http://docs.moodle.org/26/en/Caching
Abraços,