Camaradas tive o mesmo problema... derrubaram diversas vezes o site de um cliente meu com o http flood, inseri apenas estas linhas no .htaccess na raiz do site e mitigaram os ataques.
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------
os referers:
http://www.hyperfilter.com%{REQUEST_URI}? [R=301,L]
RewriteCond %{THE_REQUEST} \?(ref=.*)?\ HTTP [NC]
RewriteRule .? http://www.hyperfilter.com%{REQUEST_URI}? [R=301,L]
RewriteCond %{THE_REQUEST} \?(=.*)?\ HTTP [NC]
RewriteRule .? http://www.hyperfilter.com%{REQUEST_URI}? [R=301,L]
--------------------------------------------------------------------------------------
Mitigou no mesmo instante....